中醫(yī)基礎理論是研究中醫(yī)學基本概念、規(guī)律、原理、原則等的一門學科，是整個中醫(yī)現(xiàn)代學科群的基礎。它以獨特的研究思路與方法，客觀地概括了人體生理活動、病理變化、養(yǎng)生和防治疾病的基本規(guī)律，因而具有指導臨床實踐的作用。其內(nèi)容主要包括中醫(yī)學的哲學及方法論基礎，中醫(yī)學對正常人體與疾病的認識，以及中醫(yī)養(yǎng)生和治療原則等。

任何一門學科都受一定哲學思想的指導。中醫(yī)學以中國傳統(tǒng)文化為母體，因此，中國古代哲學及其思維方式對中醫(yī)理論體系的滲透和影響是全方位的，自始至終的。它不僅是中醫(yī)理論的指導思想，而且構成了中醫(yī)理論體系的基本內(nèi)容。首先，精氣學說（又稱“元氣論”、“氣論 ”）作為主導性自然觀，對世界“本體”問題作出了中國古代哲學的代表性闡述，并決定著中國傳統(tǒng)科學包括中醫(yī)學的研究思路、方式及其特質(zhì)，也是整個中醫(yī)理論得以建立的基石。其次是陰陽和五行學說，它們具有自然觀和方法論的雙重性質(zhì)。陰陽學說所要揭示的是宇宙萬物最一般的聯(lián)系和最深刻的本質(zhì)，是世界運動最普遍的規(guī)律；五行學說所要揭示和證明的是宇宙萬物都有一定的結構，而且具有統(tǒng)一的結構模式，并試圖具體地刻畫出系統(tǒng)事物錯綜復雜的結構關系的一般機制。中醫(yī)學家正是借用陰陽和五行學說認識生命及相關問題，分析歸納有關資料和信息，以建構中醫(yī)理論體系。另外，與元氣論、陰陽及五行學說相伴的思維方式和方法，也是中醫(yī)基礎理論的重要內(nèi)容。

中醫(yī)學對正常人體認識的理論，主要包括藏象學說、經(jīng)絡學說和精氣血津液三大學說。

藏象學說借助以“象”測“藏”的司外揣內(nèi)等方法，以研究臟腑的生理功能、病理變化及其相互聯(lián)系為中心，結合研究臟腑與形、竅、志、液及外環(huán)境的關系，它與經(jīng)絡學說構成中醫(yī)理論的核心。精氣血津液理論主要探討生命的物質(zhì)組成及其機能活動的物質(zhì)基礎，闡述其生成、運行輸布、功能、代謝、相互關系及其與臟腑之間的關系。經(jīng)絡學說主要闡釋機體聯(lián)絡通道的構成、分布、功能及病理變化等。這三種學說相互包容滲透，互為補充，構成了中醫(yī)學對人體生命獨特而精辟的認識。另外，體質(zhì)與人格，是不同個體的生理與心理特性的反映，影響著人對自然、社會環(huán)境的適應能力和對疾病的抵抗能力，以及發(fā)病過程中對某些致病因素的易罹性和病理過程中疾病發(fā)展的傾向性等，也是中醫(yī)基礎理論的主要內(nèi)容。

中醫(yī)學對疾病認識的理論，包括病因?qū)W說和病機學說。病因?qū)W說探討引起疾病的各種原因及其性質(zhì)和致病特點、規(guī)律等。病機學說主要研究疾病發(fā)生的原理及影響或誘發(fā)疾病的常見因素、發(fā)病途徑和類型、疾病發(fā)展變化和轉(zhuǎn)歸的基本機理和一些共性規(guī)律。

中醫(yī)養(yǎng)生與治則，也是中醫(yī)基礎理論的有機組成部分。養(yǎng)生學說研究人類的生命規(guī)律，探索衰老的機理，尋找增強生命活動、預防疾病、延年益壽的原則和方法。中醫(yī)基礎理論主要介紹養(yǎng)生的基本原則和主要方法。中醫(yī)治則理論根據(jù)其研究對象的抽象程度高低及在治療行為中主導作用的差異，可分為治療觀和基本治則兩部分。治療觀部分重在研究治療疾病過程中的最高層次的原則，是臨床治療時所需貫徹的基本思想；基本治則部分主要研究指導具體病證治療的一些基本原則，是治療觀的具體貫徹，又對具體治療方案、方法的選擇與確定起重要的指導作用。至于治療疾病的具體方法，則屬于中藥學、方劑學及臨床各學科的內(nèi)容。