CML的自然病程可分為慢性期和急變期，兩期之間可能有一個移行階段，稱為加速期（acceleratedphase）。

一、慢性期

此期病情穩(wěn)定，平均為3年，也有個別可長達10-20年。近幾年來由于采取有效的治療，可使急變期再回到慢性期，獲得第二次穩(wěn)定期。

二、加速期

是指患者在慢性期的治療過程中出現(xiàn)病情進展的各種征象，但尚未達到急性的標(biāo)準(zhǔn)。此期表現(xiàn)有：血及骨髓原始細(xì)胞＞5％而＜20％；骨髓膠原纖維增加；無其他原因出現(xiàn)貧血和血小板減少或血小板增高（＞1000×109／L）；出現(xiàn)新的核型異常，體外GMCFU生長異常以及白細(xì)胞攝取胸腺嘧啶脫氧核苷增加等均可作為判斷加速期的指標(biāo)。

三、急變期

骨髓或外周血原始細(xì)胞≥20％；或原始加早幼粒細(xì)胞，外周血達30％，骨髓達50％；或出現(xiàn)髓外原始細(xì)胞浸潤。

急變的細(xì)胞形態(tài)，急粒變占60％；急淋變占20％；未分化占15％；其余可為紅系，巨核或混合性變。一旦發(fā)生急變，獲第2次完全緩解＜30％，中數(shù)生存期2-6月。