北京大學醫(yī)學部的科研平臺：

截至2012年12月，北醫(yī)擁有1個國家重點實驗室，1個國家工程實驗室，29個省部級重點實驗室和研究中心。成立了糖尿病研究中心、醫(yī)學遺傳學中心、衰老研究中心、感染病研究中心、系統(tǒng)生物醫(yī)學研究所、臨床研究所、醫(yī)學信息學中心、中國衛(wèi)生發(fā)展研究中心等研究機構。 國家重點實驗室：天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室

國家工程實驗室：口腔數(shù)字化醫(yī)療技術和材料國家工程實驗室

教育部重點實驗室：分子心血管學教育部重點實驗室、神經科學教育部重點實驗室、惡性腫瘤發(fā)病機制及轉化研究教育部重點實驗室、視覺損傷與修復教育部重點實驗室、慢性腎臟病防治教育部重點實驗室、輔助生殖教育部重點實驗室

教育部工程研究中心：再生醫(yī)學教育部工程研究中心

衛(wèi)生部重點實驗室：衛(wèi)生部精神衛(wèi)生學重點實驗室、衛(wèi)生部神經科學重點實驗室、衛(wèi)生部腎臟疾病重點實驗室、衛(wèi)生部醫(yī)學免疫重點實驗室、衛(wèi)生部心血管分子生物學與調節(jié)肽重點實驗室、衛(wèi)生部生育健康重點實驗室

衛(wèi)生部工程研究中心：衛(wèi)生部口腔醫(yī)學計算機應用工程技術研究中心

北京市重點實驗室：皮膚病分子診斷北京市重點實驗室、造血干細胞移植治療血液病研究北京市重點實驗室、丙型肝炎和肝病免疫治療北京市重點實驗室、脊柱疾病研究北京市重點實驗室、生殖內分泌與輔助生殖技術北京市重點實驗室、磁共振成像設備與技術北京市重點實驗室醫(yī)學教|育網搜集整理、惡性腫瘤轉化研究北京市重點實驗室、食品安全毒理學研究與評價北京市重點實驗室、蛋白質修飾與細胞功能北京市重點實驗室、兒科遺傳性疾病分子診斷與研究北京市重點實驗室、肝硬化肝癌外科基礎研究北京市重點實驗室、骨與軟組織腫瘤診治研究北京市重點實驗室、癡呆診治轉化醫(yī)學研究北京市重點實驗室等。