氫鍵的鍵長是指X-H…Y中X與Y原子的核間距離。在HF締合而成的（HF）n締合分子中，氫鍵的鍵長為255pm，而共價鍵（F-H間）鍵長為92pm.由此可得出，H…F間的距離為163pm（255-92）?？梢姎湓优c另一個HF分子中的F原子相距是較遠的。

氫鍵的鍵能是指被破壞H…Y鍵所需要的能量。氫鍵的鍵能約為15-30kJ.mol^-1，比一般化學鍵的鍵能小得多，和范德華力的數(shù)量級相同。氫鍵的強弱與X和Y的電負性大小有關(guān)。電負性越大，氫鍵的強弱還和Y的半徑大小有關(guān)，y 的半徑越小，越能接近H-X鍵，形成的氫鍵也越強。例如F的電負性最大，半徑又小，所以F-H…F是最強的氫鍵，O-H…O次之，O-H…N又次之，N-H…N更次之。