（1）細菌性痢疾：早期腸套疊病例可誤診為菌痢。

（2）蛔蟲腸梗阻：其癥狀可與腸套疊相似，腹內(nèi)腫塊多在臍下、腹中央，有時呈索條狀。這些都與腸套疊有所不同。

（3）過敏性紫癜：腹部紫癜可伴發(fā)腸套疊，故當腹部癥狀越來越嚴重時，則需警惕腸套疊的可能。

（4）直腸脫垂：直腸脫垂時，可以清楚地看到腸黏膜一直延續(xù)到肛門周圍的皮膚，而腸套疊時，在肛門口與脫出的腸管之間有一條溝，可以通過此溝將手指伸人直腸內(nèi)，而且直腸脫垂并無急腹癥癥狀。

（5）其他：梅克爾憩室并發(fā)出血、結(jié)腸息肉脫落出血及腸內(nèi)外腫瘤等引起的出血或腸梗阻，都可能與腸套疊混淆，必須特別警惕。