腧穴的主要生理功能是輸注臟腑經(jīng)絡氣血，溝通體表與體內(nèi)臟腑的聯(lián)系。在臨床上，醫(yī)生利用腧穴的功能特點，可以對疾病進行診斷和治療。

在疾病發(fā)生時，相應的腧穴往往可出現(xiàn)壓痛、酸楚、麻木、結節(jié)、腫脹、變色、丘疹、脫屑、凹陷等各種反應。腧穴上所出現(xiàn)的不同病理反應是疾病過程中臟腑經(jīng)絡氣血失調(diào)的結果。因此，利用腧穴的病理反應特點可以幫助診斷疾病，現(xiàn)在常用的方法有：①捫穴診斷法，如同時壓迫足三里，左穴敏感者屬胃病，右穴敏感者屬十二指腸病。②望穴診斷法，如望舌下靜脈（金津、玉液）對人體內(nèi)瘀血有意義。③耳穴望診法，察看耳部皮膚的變色、變形、變性等。④儀器測定法，多利用穴位的導電特性診斷疾病。

腧穴的主治作用有：1.近治作用 這是所有腧穴主治作用中具有的共同特點。凡是腧穴均能治療該穴所在部位及鄰近組織、器官的疾病。2.遠治作用 這是十四經(jīng)腧穴主治作用的基本規(guī)律。在十四經(jīng)腧穴中，尤其是十二經(jīng)脈在四肢肘膝關節(jié)以下的腧穴，不僅能治療局部病證，而且能治療本經(jīng)循行所涉及的遠隔部位的組織、器官、臟腑的病證，甚至具有治療全身疾患的作用。3.特殊作用 大量的臨床實踐已經(jīng)證明，針刺某些腧穴，對機體的不同狀態(tài)，可起著雙相的良性調(diào)整作用。例如泄瀉時，針刺天樞能止瀉；便秘時，針刺天樞又能通便。此外，腧穴的治療作用還具有相對的特異性，如大椎退熱，至陰矯正胎位等，均是其特殊的治療作用。

通過針灸、推拿等治療方法刺激相應的腧穴，可以疏通經(jīng)絡，激發(fā)經(jīng)氣，調(diào)整氣血運行，達到扶正祛邪的目的。刺激腧穴治療疾病的作用不僅對局部臟腑、器官病癥有效，而且對相應經(jīng)脈循行路線上與該穴相距較遠的臟腑、器官病癥也有效果。這是腧穴的近治和遠治作用。腧穴的遠治作用，在十四經(jīng)穴上反映尤其突出。此外，某些腧穴還有特殊的治療作用，可專治某病，如至陰穴可矯正胎位，治療胎位不正。