病毒呈球形，直徑約為27nm.無囊膜。衣殼由60個殼微粒組成，呈20面體立體對稱，有HAV的特異性抗原（HAVAg），每一殼微粒由4種不同的多肽即VP1、VP2、VP3和VP4所組成。

在病毒的核心部位，為單股正鏈RNA.除決定病毒的遺傳特性外，兼具信使RNA的功能，并有傳染性。

HAV的單股RNA，其長度相當于7400個核苷酸。在RNA的3′末端有多聚的腺苷序列，在5′末端以共價形式連接一由病毒基因編碼的細小蛋白質(zhì)，稱病毒基因組蛋白（Viral protein ，genomic，VPG）。

它在病毒復制過程中，能使病毒核酸附著于宿主細胞的核蛋白體上進行病毒蛋白質(zhì)的生物合成。

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