山東大學藥學院前身為始建于1920年的齊魯大學藥科，是我國最早成立的高等藥學專業(yè)院校之一。國家級重點學科和機構：藥物化學國家重點（培育）學科、國家綜合性新藥研究開發(fā)技術大平臺、國家糖工程技術研究中心、天然產(chǎn)物化學生物學教育部重點實驗室。省級重點學科與實驗室：山東省藥物化學重點學科、山東省微生物與生化藥學重點學科、山東省藥劑學重點學科、山東省藥理學重點學科、山東省藥物分子設計與創(chuàng)新藥物研究重點實驗室醫(yī)|學教育網(wǎng)、山東省糖工程技術研究中心、山東省中藥標準化工程技術研究中心、衛(wèi)生部臨床藥師培訓基地、山東省執(zhí)業(yè)藥師培訓中心。學校重點科研機構：新藥安全性評價中心、藥物分析測試中心。

藥學院現(xiàn)有藥學系、制藥工程系和臨床藥學系，下設8個研究所，10個中心。全院現(xiàn)有教職工98人，其中專任教師56人，含教授28人，副教授28人，博士生導師20人。教師隊伍中具有博士學位和在讀博士學位人員達88%.現(xiàn)有國家教授2名，長江學者講座教授1名，國家杰出青年基金獲得者3名，山東省中青年杰出學科帶頭人4名，享受政府特殊津貼專家11名，全國師德先進個人1名，山東省有突出貢獻的中青年專家1名，已形成一支結構比較合理的教師隊伍和高層次的學術骨干梯隊醫(yī)|學教育網(wǎng)。

藥學院在校企聯(lián)合和成果轉化方面已形成自己鮮明的特色，與國內(nèi)多家制藥企業(yè)建立了緊密型產(chǎn)、學、研合作關系。牽頭與山東省內(nèi)20家知名制藥企業(yè)成立了“山東省重大新藥產(chǎn)業(yè)技術創(chuàng)新戰(zhàn)略示范聯(lián)盟”。（包括新華、瑞陽、齊都、新達、世博金都制藥等簽署合作協(xié)議）。分別與魯南制藥股份有限公司、山東新華制藥股份有限公司、山東齊都制藥有限公司、山東博士倫福瑞達制藥有限公司等企業(yè)簽訂了全面合作框架協(xié)議；與多家制藥企業(yè)簽訂了新藥研發(fā)實驗基地共建協(xié)議。與菏澤高新區(qū)聯(lián)合成立“山東大學菏澤藥物研究院”，與淄博高新區(qū)、新華制藥聯(lián)合成立“山東大學-淄博創(chuàng)新藥物研究院”，與山東瑞陽制藥有限公司、魯南制藥股份有限公司聯(lián)合興建了面積8500m2的山東大學藥學院科研樓，并與多家醫(yī)藥集團聯(lián)合建立科研機構。2007年，山東大學與國際著名企業(yè)拜耳醫(yī)藥保健有限公司舉行了“拜耳中國醫(yī)院發(fā)展基金—山東大學臨床藥學獎學金”簽約儀式。