與電負性大的原子X（氟、氯、氧、氮等）共價結合的氫，如與負電性大的原子Y（與X相同的也可以）接近，在X與Y之間以氫為媒介，生成X-H…Y形的鍵。這種鍵稱為氫鍵。氫鍵的結合能是2—8千卡（Kcal）。因多數(shù)氫鍵的共同作用，所以非常穩(wěn)定。在蛋白質的a-螺旋的情況下是N-H…O型的氫鍵，DNA的雙螺旋情況下是N-H…O，N-H…N型的氫鍵，因為這樣氫鍵很多，[醫(yī).學教.育網搜.集整.理]因此這些結構是穩(wěn)定的，此外，水和其他溶媒是異質的，也由于在水分子間生成O-H…O型氫鍵。因此，這也就成為疏水結合形成的原因。