在中國古代，《神農本草經》把藥物按效用分為上、中、下三品?！渡褶r本草經集注》中除沿用三品分類外，又創(chuàng)造了按藥物屬性分為草木部、果部、菜部、米谷部的方法?！侗静菥V目》中采用了自然屬性分類法，將所收藥物分為16綱60類，并以生理生態(tài)條件為依據(jù)，將草類藥分為山草、芳草、隰草、毒草、蔓草、石草、苔類等。這是中國古代最完備的分類系統(tǒng)。

　　醫(yī)學上一般按藥物性能和藥理作用分類醫(yī)學教育|網(wǎng)，中醫(yī)學常按藥物性能分為解表藥、清熱藥、祛風濕藥、理氣藥、補虛藥等類別；現(xiàn)代醫(yī)學常按藥理作用分為鎮(zhèn)靜藥、鎮(zhèn)痛藥、強心藥、抗癌藥等。藥用植物學按植物系統(tǒng)分類，則可反映藥用植物的親緣關系，以利形態(tài)解剖和成分等方面的研究。中藥鑒定學、藥用植物栽培學常按藥用部分分類，分為根、根莖、皮、葉、花、果實、種子、全草等類，便于藥材特征的鑒別和掌握其栽培特點。