人體與外界環(huán)境接觸的表面，覆蓋著一層完整的皮膚和粘膜。皮膚由多層扁平細胞組成，能阻擋病原體的穿越，只有當皮膚損傷時，病原體才能侵入。粘膜僅有單層柱狀細胞，機械性阻擋作用不如皮膚，但粘膜有多種附件和分泌液。例如呼吸道粘膜上皮細胞的纖毛運動、口腔唾液的吞咽和腸蠕動等，可將停留在粘膜表面的病原體驅(qū)趕出體外。當宿主受寒冷空氣或有害氣體等刺激，上呼吸道粘膜屏障受損傷時，就易患氣管炎、支氣管炎和肺炎等。

皮膚和粘膜能分泌多種殺菌滅毒物質(zhì)。例如皮膚的汗腺能分泌乳酸使汗液呈酸性（pH5.2-5.8），不利于細菌生長。皮脂腺分泌的脂肪酸，有殺細菌和真菌作用。不同部位的粘膜腺體能分泌溶菌酶、胃酸、蛋白酶等各種殺菌物質(zhì)。

人體的正常菌群也有拮抗病原體的作用。例如口腔中的唾液鏈球菌產(chǎn)生的過氧化氫能殺死腦膜炎奈瑟氏菌、金黃色葡萄球菌、白假絲酵母菌等；咽喉部的甲型鏈球菌能抑制肺炎鏈球菌生長等。