除來源于胎盤外所有哺乳動物的ALP同工酶都能被高精氨酸所抑制；而除來源于腸和胎盤外所有的ALP同工酶都能被左旋咪唑所抑制；而除了來源于胎盤的ALP(PALP和SEAP)外，幾乎所有的ALP都能在65℃2小時即被滅活。

單乙醇胺對堿性磷酸酶有溫度依賴的抑制作用；

較高濃度的無機磷可競爭性地抑制堿性磷酸酶的活性；

EDTA通過絡(luò)合堿性磷酸酶而導(dǎo)致該酶活性中心微環(huán)境構(gòu)象發(fā)生變化，從而不可逆地抑制堿性磷酸酶的活性；

其他的抑制劑還有聯(lián)苯胺(競爭性)、L-苯丙氨酸和丹酰-L-苯丙氨酸(反競爭性)、含氮雜環(huán)氧釩配合物(選擇性)、五氯酚(對人胎盤堿性磷酸酶反競爭性抑制)等。