根據(jù)側(cè)鏈R的極性不同分為非極性和極性氨基酸。

氨基酸的R基團(tuán)不帶電荷或極性極微弱的屬于非極性中性氨基酸，如：甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、蛋氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、脯氨酸。它們的R基團(tuán)具有疏水性。

氨基酸的R基團(tuán)帶電荷或有極性的屬于極性氨基酸，它們又可分為：

（1）極性中性氨基酸：R基團(tuán)有極性，但不解離，或僅極弱地解離，它們的R基團(tuán)有親水性。如：絲氨酸、蘇氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、谷氨酰胺、天門冬酰胺。

（2）酸性氨基酸：R基團(tuán)有極性，且解離，醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)搜集整理在中性溶液中顯酸性，親水性強(qiáng)。如天門冬氨酸、谷氨酸。

（3）堿性氨基酸：R基團(tuán)有極性，且解離，在中性溶液中顯堿性，親水性強(qiáng)。如組氨酸、賴氨酸、精氨酸。